ну, Бергена, чтоб тебе прищемили нос, который ты везде суешь.

тут уместен восклицательный знак в конце предложения: подчеркнёт эмоциональность фразы.

Они ворвались в его жизнь(,) как ураган.

Удивительно быстро, оборота не прошло

вместо зпт. тут лучше тире.

И повязку с глаз заставили снять. Поменяли на металлический шлем, закрывающий лоб, глазницы и неприятно врезающийся краем в скулы.

как вариант, можно сделать так: «И повязку с глаз заставили снять, поменяв её на металлический шлем, закрывающий лоб, глазницы и неприятно врезающийся краем в скулы».

рассчитанная на две сотни человек, — и это

зпт. тут не нужна.

С площадки (-) отдельная тропка к маленькой пещерке индивидуальных встреч

Морио слышал Герса чаще всего; его громкий и резкий голос рыскал

вот тут — имхо — по контексту больше подойдёт не точка с запятой, а двоеточие.

И в его голос Морио врезался

тут ударение на первый слог или на второй? То есть, начинается рассказ о конкретном случае или подчёркивается постоянство действия?

В закутке Герс ругал напарника, молодого А́миа, учетчика, ведущего списки визитеров, подсчитывающего все, что может быть посчитано в деле помощи Сияющему, и следящего, чтобы траты не превышали энерго-доход.

 как это город не обложил налогом такую полезную деятельность?

как ты по девицам рыскаешь, вместо того

зпт. не нужна.

Язык, что руки…

зпт. не нужна.

Поначалу он удивлялся волевым заявлениям своих помощников, поначалу упрямился — что это они ему указывают! Но то ли привык, то ли благодарность за «пишущий» браслет, позволивший шире общаться с миром, заслонила недовольство их дерзостью.

имхо, это можно сделать одним предложением:

«Поначалу он удивлялся волевым заявлениям своих помощников, поначалу упрямился — что это они ему указывают! — но то ли привык, то ли благодарность за «пишущий» браслет, позволивший шире общаться с миром, заслонила недовольство их дерзостью».

чтобы пальцы свисали, будто бы скучающе

зпт. не нужна.

Наконец, Джас вошел к закуток

зпт. не нужна.

Джас, громко сопя и пыхтя, добрел до длинной скамьи, поставленной у стены напротив кресла Сияющего. Долго садился и пристраивал свою палку. Наконец спросил:

это можно сделать одним предложением.

и его тон будто время вспять повернул

имхо, лучше так:… и его тон будто вспять повернул время.

Морио чуть приподнял левую руку, показывая Амиа не пререкаться. Потом кивнул Джасу.

это можно сделать одним предложением.

Вылучу спазм в груди, умрешь от закупорки сосудов.

вместо зпт. лучше тире.

Уберу бляшки, тебя убьет какая-нибудь из опухолей…

тут тоже.

в которых что-то строил и укреплял О-Моор Сияющий, до того

зпт. не нужна.

то, якобы, полученное лучение усиливается

обе зпт. не нужны.

что, если после сеанса

зпт. не нужна.

По привычке, он потер лицо ладонями

зпт. не нужна.

После лучения шумит в ушах, и кровь идет носом.

в данном случае зпт. не нужна.

от которых не увернешься, какая-нибудь да навалится

вместо зпт. правильней тире.

в угоду сомнительной байке покидать безопасные земли, подставляться под гравитационные удары

вместо зпт. лучше «и».

Позже перестал не то, чтобы выходить за пределы Грузового

тут имеется в виду, наверно, «не то что выходить за пределы».

Вы послали меня за Долговязую, проверить край

зпт. не нужна.

и, после его сеансов и стабилизации, людям полезнее

обе зпт. не нужны.

В Сером Краю плюхи прыгают(,) как кузнечики

со стуком коснулся ее гулким шлемом.

может, лучше так: «со стуком коснувшись её гулким шлемом»?

и наведет порядок с плюхами, — забыли собственные силы

зпт. не нужна.

и пусть несут, куда хотят

зпт. не нужна.

Морио подождал, когда земля перед ним станет черной-черной, когда из бокового зрения вытекут все краски. Потом поднял голову, распахивая глаза навстречу бесцветному миру.

это можно сделать одним предложением.

Люди на площадке забегали, выстраиваясь за натянутыми тросами заграждения. Принялись толкаться и выяснять, где кому стоять.

это тоже.

вглядывался в темные, в тусклые равнины,

предлог явно лишний.

на который наматывается воздух и ветер.

«наматываЮтся».

Но (Морио) пересилил себя и продолжил:

просится вставка.

Вы (-) сильные Мастера

Все в недоумении рассядутся по своим миасам, разъедутся по домам

вместо зпт. лучше «и».

на осколке порядок и работы непочатый край.

тут по желанию можно сделать так: «на осколке — порядок, и работы — непочатый край». Не правлю в цитате потому, что не уверен, правильно ли интерпретирую интонацию фразы.