Заодно расспросите обо всем, что он видел… А видит он побольше Хью, уж поверьте.

Если в первом предложении «видел», во втором тоже должно быть «видел».

высоким и с пышной шевелюрой, но нос совал во все точно также. А третий…

… точно так же — раздельно.

Хотя если успеют, пусть делают… Это моя плата? Я еще легко отделался, да?

После «хотя» — зпт.

— Смерть никогда не происходит красиво.

Вообще-то говорят, смерть никогда не бывает красивой, но можно оставить, как речь персонажа.

Нельзя было копать землю прямо надо туннелями извергов.

… над туннелями…

Наверняка, еще дорылись до какого-то хода?

Наверняка — наречие, зпт не нужна.

На всякий случай, забрав у Сергиенко спички, Андрей пошел по недостроенным путям.

После «На всякий случай» — зпт не нужна — это причастный оборот целиком.

Но она не показалась до тех пор, как он дошел до туннеля.

Либо: Но она не показалась, пока он не дошёл до туннеля. Или: Но она не показалась до тех пор, пока он не дошёл до туннеля.

Очертания черной дыры, даже скорее ниши в стене.

«скорее» — вводное слово: Очертания черной дыры, даже, скорее, ниши в стене.

Химера напоминала странного зверя с волчьей головой, от которой мало что осталось, и раздвоенным гибким телом.

А что значит — раздвоенное гибкое тело? Может, хвост?

Значит, нельзя, дать повод думать, что я профилонил…

После «нельзя» — зпт не нужна.

Голос комиссара доносился, как из бочки.

Здесь перед «как» зпт не нужна

Вера же только стояла удивленно хлопала ресницами.

… стояла и удивлённо хлопала…

Да, проходите, проходите на кухню. Можете не разуваться.

После «да» зпт не нужна