Спасибо большое за такой подробный разбор! Да, многие детали возникали во время написания, некоторые уже во время того, как спустя день-два после написания я перечитывал текст. Попытаюсь разобраться с вашими замечаниями… Так, по порядку:

То доктор поговорил с капитаном, а потом только выясняется, что по каюте порхают ягоды

Тут я немного не понял. Сцена начинается со слов:

Запивая ягоды моско их же соком, капитан парил

потом

— капитан указал на ягоды, от которых сам был давно не трезв. —

и только потом

Доктор Отви подлетел к парящей ягоде и отправил ее в рот.

То, что они там парят подразумевается отсутствием гравитации на корабле.

то в середине первой части всплывает информация о том, что доктор общался с президентом и получил премию. А почему не в начале-то рассказа, когда доктор рассуждает о том, как надо быть полезным, чтобы не быть замененным на другого сотрудника

согласен, это было бы логичнее. Нужно будет доработать этот момент.

Как его могут заменить на другого сотрудника, когда они уже улетели на другую планету, вопрос отдельный…

заменить могли во время подготовки к отлету, о чем и говорится в начале. Важно было сразу понравиться капитану и участвовать в подготовке, хотя это и не входило в обязанности доктора.

И вот, герои уже прилетели на планету и вдруг, когда уже ничто, казалось бы, не предвещало, новый кусок информации об устройстве мира, видящих, вольных, богине единого человеческого разума…

))) да, это все, конечно, так. Дело в том, что рассказ скорее всего станет частью цикла рассказов, идея о котором давно мне покоя не дает. И в голове столько всего накрутилось, что вот так внезапно для читателя могут вывалиться неожиданные детали.

Ох уж эта моя муха! Она стала настоящим яблоком раздора, что для меня совершенно неожиданно))

А вот пробирку можно было бы обыграть и поинтереснее. Вещество в ней могло красиво засветиться, доктор мог открыть ее, ожидая увидеть какое-нибудь дерево или что-то в этом роде, а коварное вещество сбежало бы, чтобы тераформировать планету, населенную агрессивными существами, уничтожающими Вселенную

 так это же сюжет на целый роман!)))

АБК — агентство биологического контроля. В тексте где-то есть, но надо бы сделать сноску.

С курткой капитана коряво вышло, согласен.

Про клонов требуется отдельное разъяснение, которое я сделать забыл. В качестве рабочих как правило используются клоны. Не капитана, конечно)) В данном случае это сравнимо с фразой «что грузчик из трюма случайно оказался в зале управления кораблем»

Ренье — конкурирующая корпорация. Опять же сноски не хватает.

А входящий вызов он без линз дополненной реальности проверял? Почему они только сейчас всплывают? Если они есть, значит, на них должна какая-то информация поступать о том, о сем.

«Ноэль перевел взгляд с планеты на мигающий значок входящего вызова на настенной панели и приказал воспроизвести сообщение.» Но обыграть наличие линз лучше раньше, согласен.

А нельзя было выслать вперед робота, чтобы провел анализ, а потом уже людей выпускать?

сперва капитан говорит: "— Смотрите, Ноэль. Сюда мы забросим вас завтра вместе с рабочими. От дронов получены первые данные, основные среднесуточные показатели позволяют находиться на поверхности в легких скафандрах. Подробный анализ данных уже закончен, вся информация у вас. Можете изучить, если возникнет желание." и потом ответ в приведенной вами же цитате: "— Подтверждаю предварительный анализ, угрозы для скафандров нет, — успокоил Отви охрану" То есть анализ уже проводился, но такие вещи проверяются чтобы полностью исключить угрозу. Что и сделал доктор.

Огромное спасибо за пожелание и еще раз за ценные замечания!