Потому что о восклицательном знаке сказано в начале параграфа

Прямая речь в диалоге оканчивается запятой (восклицательным или вопросительным знаком, или многоточие). Я привёл правило.

Совершенно верно. В примечании сказано о букве, с которой начинаются авторские слова. А о знаке препинания сказано в начале параграфа. Это запятая, восклицательный или вопросительный знак или многоточие. Потому что весь параграф говорит о знаках препинания. А примечание №2 — о первой букве т.н. «отдельного предложения». А о знаках препинания говорит сам параграф.

Перед прописной буквой запятая ставится в тех случаях, когда она ставится перед прописной буквой. Например:

— Пошли жрать, — Николай Николаевич говорил основательно и веско.

Запятая. Перед прописной буквой. Обусловленная тем, что первым идёт имя собственное.

А в случае т.н. «отдельного предложения» прописная буква обусловлена примечанием №2. А запятая — требованиями параграфа, к которому примечание. Иначе было бы просто смешно: параграф требует запятой, восклицательного или вопросительного знака, или многоточия, а примечание почему-то вдруг — разрешает ставить точку! Чушь и нонсенс. Примечание разрешает использовать прописную букву там, где в норме используется строчная. Именно этому посвящено примечание, а вовсе не разрешению ставить точку там, где должна быть запятая.

Потому что в этом случае имелось бы примечание №3:

"В том случае, когда особые грамотеи хочут поставить точку, они ставят точку"Потому что примечание — к правилу!!! А не к фантазиям безграмотных редакторов и корректоров.